Der Polderbereich Thundorf/Aicha wird vom Hochwasserdeich an der Donau und vomrechten Rückstaudeich des Stögermühlbaches geschützt (Schutzgrad HQ30). Die unterstromige Be-grenzung des Polders bildet der Hochrand entlang des Haardorfer Mühlbaches. Der Polder Haardorf erstreckt sich entlang des Bettes des Haardorfer Mühlbach und kann in sich als eigener kleiner Polder betrachtet werden.
Der Donaudeich weist von Donaukilometer 2279 bis 2275,7 (Schöpfwerk Thundorf) eine Innen-dichtung (Einphasenschlitzwand) auf, die in den Auelehm einbindet. Weiter in Richtung Unter-strom ist keine Innendichtung vorhanden, die Deichdichtung besteht lediglich aus einer wasser-seitigen Lehmdichtung. Gleiches gilt für den rechten Stögermühlbachdeich. Die Überflutungs-höhe im Polder beträgt beim HW100-Wasserstand bis zu 3,5 Meter.
